Pese a los esfuerzos de todos los profesionales involucrados en el tratamiento y seguimiento de los afectados de Queratocono, en ocasiones la cornea se degenera de forma irreversible y los optometristas especializados no consiguen adaptar ninguna lente de contacto que proporcione una calidad visual suficiente. Tras agotar también todos los recursos médicos antes mencionados, se debe valorar la realización de una Queratoplastia, es decir, un trasplante de cornea. Las técnicas de realización han mejorado mucho en los últimos años y tras su realización es posible adaptar de nuevo ayudas ópticas (gafas y/o lentes de contacto) para mejorar la visión.